Der Sobat, der Hauptzufluss des Nils, mündet oberhalb von Malakal im Südsudan in den Baḥr al-Jabal (Gebirgsnil) und bildet den Weißen Nil. Der Sobat wird durch den Zusammenfluss seiner beiden Hauptströme - Baro und Pibor - an der äthiopischen Grenze südöstlich von Nāṣir im Südsudan gebildet. Andere äthiopische Hauptströme sind der Jokau, der Gilo und der Akobo. Vom Zusammenfluss Baro-Pibor fließt der Fluss in einer Reihe von Mäandern etwa 354 km westnordwestlich bis zu seiner Mündung am Baḥr al-Jabal und empfängt zwei Bäche, den Khawr Nyanding und den Khawr Ful Lus, aus dem Süden.
Bei Annäherung an den Nil vertieft sich der Sobat auf 5,5 bis 9 Meter und verengt sich auf 400 Fuß. Sein enormer Abfluss bei Hochwasser (November - Dezember) trägt ein weißliches Sediment, das dem Weißen Nil seinen Namen gibt. Die Flüsse Sobat und Baro können mit dem Dampfer (Juni - Dezember) stromaufwärts nach Gambela, Äthiopien, befahren werden. Die Wasserstraße Sobat-Pibor befördert im gleichen Zeitraum kleine Fahrzeuge zur Pibor Post, etwa 130 Meilen den Pibor hinauf von ihrer Kreuzung mit dem Baro. Eine Fähre überquert den Sobat unterhalb der Mündung des Khawr Ful Lus. Während der Trockenzeit deckt der Rückgang des Flussniveaus Land ab, das als Weideland genutzt wird, und bietet so Weideflächen für die Viehhalter der Region.
