Die Seychellen, ehemals eine britische Kolonie, wurden am 29. Juni 1976 unabhängig. Die damals hisste Flagge hatte abwechselnd blaue und rote Dreiecke, die durch ein weißes diagonales Kreuz getrennt waren. Vielleicht nicht zufällig war diese Flagge fast genau die gleiche wie die der Australasian United Steam Navigation Company, deren Schiffe zu Beginn des 20. Jahrhunderts regelmäßig die Inseln besuchten. Die Flagge hielt nicht lange an: Am 5. Juni 1977 fand unter der Führung der Seychelles People's United Party (SPUP) eine Revolution statt. Die neue Flagge hatte rot-über-grüne horizontale Streifen, die durch ein welliges weißes Band getrennt waren, das mit Ausnahme des Weglassens einer gelben Sonne in der Mitte mit der SPUP-Flagge identisch war.
1993 führte der Druck ausländischer Mächte zur Demokratisierung der Regierung. Die Regierungspartei verlor ihr Wahlmonopol, und die Beteiligung anderer Parteien an der Regierung führte zu einer Forderung nach einer weniger parteiischen Nationalflagge. Das Parlament genehmigte einen Entwurf, der die Farben verschiedener Parteien in eine Flagge einbezog, die am 18. Juni 1996 gehisst wurde. Die Farben der Flagge sind blau (für Himmel und Meer), gelb (für die lebensspendende Sonne), rot (für die Menschen und ihre Arbeit für Einheit und Liebe), Weiß (für soziale Gerechtigkeit und Harmonie) und Grün (für Land und natürliche Umwelt).
