Als die Sowjets in Westturkestan an die Macht kamen und Gleichheit und Entwicklung für alle ethnischen Gruppen versprachen, erlangte das kirgisische Volk 1924 eine eigene autonome Region. 1926 wurde sie zur autonomen Republik erhoben und 1936 zu einer Union Republik innerhalb der UdSSR 1953 übernahm die kirgisische SSR eine modifizierte Version des sowjetischen roten Banners, indem sie einen weiß umrandeten blauen horizontalen Streifen durch die Mitte fügte. Nachdem Kirgisistan am 31. August 1991 seine Unabhängigkeit proklamiert hatte, benutzte es seine sowjetische Flagge bis zum 3. März 1992 weiter.
Der Hintergrund der neuen Flagge, die heute noch verwendet wird, ist ebenfalls rot, aber dies soll von einer Flagge des kirgisischen Nationalhelden Manas der Edle stammen. In der Mitte der Flagge steht eine gelbe Sonne mit 40 Strahlen, die den Anhängern von Manas und den Stämmen entspricht, die er vereint hat. seine weiteren symbolischen Attribute sind Licht, Adel und Ewigkeit. Auf dieser Sonne befindet sich ein rot-gelbes Emblem mit zwei gekreuzten Sätzen von jeweils drei Linien, alle innerhalb eines Rings. Dies ist eine stilisierte Ansicht des Daches des traditionellen kirgisischen Hauses, der Jurte. Nur wenige Kirgisen leben noch in Jurten, aber bis Mitte des 20. Jahrhunderts gründete eine Mehrheit dieser Nomaden Jurten, wohin sie auch reisten. Die symbolische Bedeutung dieses Entwurfs ist ausführlich: Das Flaggengesetz spricht vom Ursprung des Lebens, der Einheit von Zeit und Raum, der Geschichte des kirgisischen Volkes, der Solidarität sowie von Herd und Heimat.
